Özel Bahçeşehir Koleji Atakent Tema Ortaokulu, 21. yüzyılın getirdiği bilgi ve becerilere sahip bireyler yetiştirmek amacı ile eğitim programlarını çeşitlendirmektedir. Milli Eğitim Bakanlığının eğitim müfredatına uygun olarak Bahçeşehir Üniversite'sinin geliştirdiği özgün eğitim modelleri ile öğrencilerinin başarı katsayısını artırmak ve bu doğrultuda geleceğe faydalı bireyler yetiştirmek amacı ile eğitim hizmeti vermektedir. Sürekli güncellenen ve 21. yüzyıl ihtiyaçlarını öğrencilere kazandırmaya yönelik uygulanan eğitim ile akademik başarıların önündeki engelleri kaldırarak öğrencilere sosyal ve kültürel yetkinlikler kazandırmayı da amaçlamaktadır.
Özel Bahçeşehir Koleji Atakent Tema Ortaokulu'nda kişiye özgü eğitim modeli yani "KÖM" uygulanmaktadır. Bu eğitim modelinde amaç her öğrencinin kendisine has olan öğrenme eğilimini belirlemek ve bu doğrultuda öğrencilerin eğitimi doğru biçimde karşılamasını sağlamak ön plandadır. Tüm bunlarla birlikte Küçükçekmece Bahçeşehir Koleji'nde Mentor Öğretmenlik Sistemi uygulanmaktadır.